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Revista Panamericana de Salud Pública

Print version ISSN 1020-4989

Abstract

SALCEDO-CIFUENTES, Mercedes; DOMINGUEZ, Martha C  and  GARCIA-VALLEJO, Felipe. Epidemiología genómica y paraparesia espástica tropical asociada a la infección por el virus linfotrópico humano de células T tipo 1. Rev Panam Salud Publica [online]. 2011, vol.30, n.5, pp. 422-430. ISSN 1020-4989.  http://dx.doi.org/10.1590/S1020-49892011001100004.

OBJETIVO: Caracterizar el ambiente genómico de las secuencias adyacentes al virus linfotrópico humano de células T tipo 1 (HTLV-1) en pacientes con paraparesia espástica tropical y mielopatía asociada a la infección con HTLV-1 (PET/MAH) de diferentes regiones de Colombia y del Japón. MÉTODOS: Se enfrentaron 71 clones recombinantes con secuencias del genoma humano adyacentes al 5'-LTR de pacientes con PET/MAH, a las bases de datos del Genome Browser y del Gen-Bank. Se identificaron y analizaron estadísticamente 16 variables genómicas estructurales y composicionales mediante el programa informático R, versión 2.8.1, en una ventana de 0,5 Mb. RESULTADOS: El 43,0% de los provirus se localizaron en los cromosomas del grupo C; 74% de las secuencias se ubicaron en regiones teloméricas y subteloméricas (P < 0,05). Un análisis de conglomerados permitió establecer las relaciones jerárquicas entre las características genómicas incluidas en el estudio; el análisis de componentes principales identificó las componentes que definieron los ambientes genómicos preferidos para la integración proviral en casos de PET/MAH. CONCLUSIONES: El HTLV-1 se integró con mayor frecuencia en regiones de la cromatina ricas en islas de citocina fosfato guanina (CpG), de alta densidad de genes y de repeticiones tipo LINE (elemento disperso largo [long interspersed element]) y transposones de ADN que, en conjunto, conformarían los ambientes genómicos blanco de integración. Este nuevo escenario promoverá cambios sustanciales en el campo de la salud pública y en el manejo epidemiológico de las enfermedades infecciosas, y permitirá desarrollar potentes herramientas para incrementar la eficiencia de la vigilancia epidemiológica

Keywords : Virus linfotrópico de células T humanas tipo 1; integración viral; linfocitos; genoma humano; paraparesia espástica tropical; epidemiología molecular; Colombia.

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