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<article-title xml:lang="es"><![CDATA[Prueba molecular Genotype® MTBDRplus, una alternativa para la detección rápida de tuberculosis multidrogorresistente]]></article-title>
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<abstract abstract-type="short" xml:lang="en"><p><![CDATA[The Genotype®MTBDRplus molecular test is a method that allows identification of the most frequent mutations associated with resistance to major first-line antituberculosis drugs, Isoniazid (INH) and Rifampicin (RFP). The aim of this study was to evaluate the performance of the molecular test with culture and smear- positive sputum samples. We evaluated 95 cultures and 100 sputum samples with resistance profiles previously determined by the reference method "Agar Plate Proportions" (APP). The molecular test from cultures showed a sensitivity of 100 %, 97,5 % and 96,97 % for RIF, INH and MDR respectively while from sputums the sensitivity was 95,65 %, 96,77 % and 95,24 % for RIF, INH and MDR respectively. We conclude that the molecular test Genotype®MTBDRplus is a very useful tool to detect resistance to isoniazid and rifampicin simultaneously (MDR-TB) in up to 72 hours from sputum samples or cultures.]]></p></abstract>
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</front><body><![CDATA[ <p align="right"><b><font face="Verdana" size="2">ORIGINAL BREVE</font></b></p>      <p align="justify"><b><font face="Verdana" size="4">   Prueba molecular Genotype&#174 MTBDRplus, una alternativa para la detección rápida de tuberculosis multidrogorresistente</font></b></p>      <p align="justify"><b><font face="Verdana">   Molecular test Genotype&#174 MTBDRplus, an alternative to rapid detection of multidrug   resistance tuberculosis</font></b></p>      <p align="justify">&nbsp;</p>      <p align="justify"><b><font face="Verdana" size="2">   Luis Asencios<sup>1,a</sup>, Marco Galarza<sup>1,b</sup>, Neyda Quispe<sup>1,c</sup>, Lucy Vásquez<sup>1,c</sup>, Elena   Leo<sup>1,c</sup>, Eddy Valencia<sup>1,c</sup>,   Juan Ramírez<sup>1,c</sup>, Margoth Acurio<sup>1,c</sup>, Rosario Salazar<sup>1,c</sup>, Alberto Mendoza   -Ticona<sup>2,d</sup>, Omar Cáceres<sup>3,b</sup></font></b></p>      <p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   1 Laboratorio de Referencia Nacional de Micobacterias, Instituto Nacional de   Salud. Lima-Perú</font></p>      <p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   2 Unidad de Análisis y Generación de Evidencias en Salud Pública, Centro   Nacional de Salud Pública, Instituto Nacional de Salud. Lima-Perú</font></p>      <p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   3 Laboratorio de Biotecnología y Biología Molecular, Instituto Nacional de   Salud. Lima-Perú</font></p>      <p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   a Biólogo, magíster en Salud Pública; b biólogo, magíster en Bioquímica y   Biología Molecular; c biólogo; d médico infectólogo</font></p>  <hr>      <p align="justify"><b><font face="Verdana" size="2">   RESUMEN</font></b></p>      ]]></body>
<body><![CDATA[<p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   La prueba molecular Genotype&#174MTBDRplus, es un método que permite identificar las   mutaciones más frecuentes   asociadas con la resistencia a las drogas antituberculosas de primera línea:   isoniacida (INH) y rifampicina (RIF). El objetivo   de este estudio fue evaluar el desempeño de la prueba molecular con cultivos y   muestras de esputo con baciloscopía   positiva. Se evaluó 95 cultivos y 100 esputos con perfiles de resistencia   previamente determinados por el método de   referencia “proporciones agar en placa” (APP). La prueba molecular a partir de   cultivos mostró una sensibilidad de 100%;   97,5% y 96,9% para RIF, INH y multidrogorresistente (MDR) respectivamente;   mientras que para esputo la sensibilidad   fue de 95,7%; 96,8% y 95,2% para RIF, INH y MDR respectivamente. Se concluye que   Genotype&#174MTBDRplus es una   herramienta muy útil para la detección rápida de la resistencia a INH y RIF   simultáneamente (MDR) en un máximo de   72 h a partir de esputo o de cultivo.</font></p>      <p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   <b>Palabras clave:</b> Tuberculosis farmacorresistente; Técnicas de diagnóstico   molecular; Mutación; Isoniacida; Rifampicina;   Validez de las pruebas; Perú (fuente: DeCS BIREME).</font></p>  <hr>      <p align="justify"><b><font face="Verdana" size="2">   ABSTRACT</font></b></p>      <p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   The Genotype&#174MTBDRplus molecular test is a method that allows identification of   the most frequent mutations   associated with resistance to major first-line antituberculosis drugs, Isoniazid   (INH) and Rifampicin (RFP). The aim of   this study was to evaluate the performance of the molecular test with culture   and smear- positive sputum samples. We   evaluated 95 cultures and 100 sputum samples with resistance profiles previously   determined by the reference method   “Agar Plate Proportions” (APP). The molecular test from cultures showed a   sensitivity of 100 %, 97,5 % and 96,97 % for   RIF, INH and MDR respectively while from sputums the sensitivity was 95,65 %,   96,77 % and 95,24 % for RIF, INH and   MDR respectively. We conclude that the molecular test Genotype&#174MTBDRplus is a   very useful tool to detect resistance   to isoniazid and rifampicin simultaneously (MDR-TB) in up to 72 hours from   sputum samples or cultures.</font></p>      <p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   <b>Key words:</b> Tuberculosis, multidrug-resistant; Molecular diagnostic techniques;   Mutation; Isoniazid; Rifampin; Validity of   tests; Peru (source: MeSH NLM).</font></p>  <hr>      <p align="justify"><b><font face="Verdana" size="2">   INTRODUCCION</font></b></p>      <p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   El Perú es el país con mayor número de personas   afectadas de tuberculosis multidrogorresistente (TBMDR),   es decir con resistencia simultánea a isoniacida   (INH) y rifampicina (RIF), y uno de los veinte países con   mayor severidad de la enfermedad en el mundo (1,2). Cada   año se informan más de 1800 personas que ingresan al   tratamiento de TB MDR, pero solo el 70% acceden a la   prueba de sensibilidad, de ellos, el 80% son casos de TB   MDR, por lo que se informa de aproximadamente 1500   personas como casos comprobados de TB-MDR por el   Ministerio de Salud (MINSA).</font></p>      <p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   El incremento de la resistencia de <i>Mycobacterium tuberculosis</i> pone en riesgo a la población de infectarse   con cepas resistentes; por ello, es necesaria la detección   rápida de TB-MDR a partir de muestras de esputo,   utilizando métodos basados en biología molecular,   los cuales han demostrado tener alta sensibilidad,   especificidad y rapidez, pues reducen los tiempos en   la obtención de los resultados. Generalmente, estos   que la resistencia a RIF se debe a mutaciones presentes   en la región “core” de 81 pb del gen que codifica a la   subunidad &#946; de la ARN polimerasa bacterial (rpoB). Se   ha determinado que más del 95% de la resistencia a RIF   está presente en esta región, tanto a nivel mundial como   en Perú (3,4).</font></p>      <p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   Por otro lado la resistencia a INH se debe a mutaciones   presentes en tres genes principales de la bacteria:   1) katG, que codifica la enzima catalasa-peroxidasa,   donde 50 a 95% de las mutaciones ocurren en el codón   315; generalmente la presencia de mutaciones es este   gen es un indicador de alta resistencia a la droga.   2) La región promotora del gen inhA que codifica una   NADH enoil ACP reductasa, donde la resistencia se   presenta entre 20 a 35% y es un indicador de baja   resistencia. Finalmente 3) La región intergénica oxyRahpC   que codifica a la región regulatoria de la enzima   alkylhidroperoxidasa y que está involucrada de 10 a   15% de la resistencia a la droga (3).</font></p>      <p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   La prueba Genotype&#174MDRTBPlus utiliza tiras reactivas   de nitrocelulosa (tecnología DNA Strip) (5) que contienen   regiones parciales de los genes rpoB, katG e inhA fijadas   sobre ella. La prueba está basada en un PCR multiplex   que genera múltiples productos de amplificación (sondas)   los cuales, mediante una hibridación reversa, reconocen   las mutaciones génicas (en forma de bandas sobre la tira)   más frecuentes asociadas con la resistencia a isoniacida   y rifampicina. Esta prueba es novedosa, útil y rápida para   la detección de la resistencia a drogas antituberculosas.</font></p>      ]]></body>
<body><![CDATA[<p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   Una tira de Genotype&#174MTBDRplus contiene 27 bandas   de reacción: 21 bandas que señalan las mutaciones   (once bandas wild type (WT) es decir no presenta   mutaciones y diez bandas de resistencia a antibióticos   (MUT)) y seis bandas control (CC: control de conjugado,   AC: control de amplificación, TUB: control de complejo   <i>M. tuberculosis</i> y controles de amplificación para los   locus (genes) rpo&#946;, katG e inhA). Las once bandas WT   incluyen ocho bandas para el gen rpo&#946;, una banda WT   para el gen katG y dos bandas WT para el gen inhA,   mientras que las diez bandas MUT incluyen cuatro   bandas con mutaciones para el gen rpo&#946;, dos bandas   con mutaciones para el gen katG y cuatro bandas con   mutaciones para el gen inhA (<a href="#fig01">Figura 1</a>) (6).</font></p>      <p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   La presencia de una o más bandas MUT, la ausencia de   una o más bandas WT o la combinación de ambas en   cada zona de la droga, será señal de la existencia de   cepas resistentes a una droga o a ambas.</font></p>      <p align="justify"><a name="fig01"></a></p>      <p align="center">      <img src="/img/revistas/rpmesp/v29n1/a14fig01.jpg"></p>      <p align="justify">&nbsp;</p>      <p align="justify"><font face="Verdana" size="2">                                 El objetivo del presente estudio fue determinar el   desempeño en laboratorio de la prueba molecular   Genotype&#174MTBDRplus (Hain LifeScience, Nehren,   Alemania) para la detección rápida de la resistencia   a INH y RIF a partir de cultivos de <i>M. tuberculosis</i> y   muestras de esputo baciloscopía positiva, siendo ambos   tipos de muestra con resistencia conocida.</font></p>      <p align="justify"><b><font face="Verdana" size="2">   EL ESTUDIO</font></b></p>      <p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   El presente trabajo es un estudio de tipo descriptivo   y experimental en laboratorio, de la prueba molecular   Genotype&#174MTBDRplus.</font></p>      <p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   Se seleccionó aleatoriamente un total de 95 cultivos   positivos con no menos de diez colonias, provenientes   de pacientes nuevos con tuberculosis y pacientes antes   tratados sin ninguna razón de proporcionalidad entre   ellos. El criterio de selección fue que las muestras fueran   previamente analizadas por la prueba de referencia   “proporciones agar en placa” (APP) (7) para determinar la   resistencia a INH y RIF, en el Laboratorio de Referencia   Nacional de Micobacterias del Instituto Nacional de   Salud, en el año 2010.</font></p>      <p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   Adicionalmente, cien muestras aleatorias de esputo   con baciloscopía positiva (mínimo una cruz) y resultado   conocido de susceptibilidad antibiótica, evaluados   previamente por APP, fueron también incluidas en el   estudio. Estas muestras se descontaminaron siguiendo   el método convencional con N-Acetil-L-cisteína   y NaOH (8). Después de la descontaminación, los   sedimentos concentrados fueron resuspendidos en 1,0   mL de buffer fosfato (pH 7,5) y almacenados a 4 °C   hasta la extracción de ADN.</font></p>      ]]></body>
<body><![CDATA[<p align="justify"><i><font face="Verdana" size="2">   PRUEBA DE SUSCEPTIBILIDAD</font></i></p>      <p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   Se realizó por el método de APP, prueba de referencia   reconocido por la OMS para la determinación de   susceptibilidad a drogas antituberculosas (7), usando   concentraciones críticas de 0,2 &#956;g/mL y 1,0 &#956;g/mL para   isoniacida y 1,0 &#956;g/mL para rifampicina. A partir de   aislamientos en medio sólido Lowenstein-Jensen (LJ),   se realizó la siembra en caldo Middlebrook 7H9 y se   incubaron a 37 °C por 7 días. Una parte del cultivo en   medio líquido se separó y se ajustó la turbidez a escala   Mc Farland 0,5. A partir de ella se prepararon diluciones   (10–1 a 10-4) en solución salina-Tween 80, luego se   sembraron en placas con medio Middlebrook 7H10 y   se incubaron a 37 °C por 21 días. Las lecturas de las   placas se realizaron con el conteo de colonias en la   placa control frente a las placas conteniendo las drogas.   Para la interpretación del resultado se consideró las   proporciones críticas, si la proporción crítica fue mayor   a 1%, se informó como “resistente”; y si fue menor al   1%, se informó como “sensible”.</font></p>      <p align="justify"><i><font face="Verdana" size="2">   EXTRACCIÓN DE ADN</font></i></p>      <p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   De un aislamiento se extrajo una azada de colonias   que luego se resuspendió en un tubo de 1,5 mL con   tapa rosca conteniendo 300 &#956;L agua destilada estéril.   Para muestras clínicas, se utilizó 500 &#956;L de esputo   descontaminado. Se concentró las bacterias por   centrifugación durante 5 minutos a 12000 rpm en una   microcentrífuga (rotor con contención de aerosoles). Se   desechó el sobrenadante y se resuspendió el sedimento   en 200 &#956;L agua estéril (cultivo puro) o 100 &#956;L agua   estéril (esputo) agitando con un vórtex. Se incubó la   muestra durante 20 min a 100 °C en baño María y luego   se incubó durante 15 min en un baño de ultrasonidos   (sonicador). Finalmente, se centrifugó a 12 000 rpm por   5 min, luego se transfirió el sobrenadante (ADN) a un   tubo de 1,5 mL nuevo y estéril y se almacenó a -20 °C   hasta realizar la PCR.</font></p>      <p align="justify"><i><font face="Verdana" size="2">   GENOTYPE&#174MTBDRplus</font></i></p>      <p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   Para la amplificación génica se utilizó 35 &#956;L de   mezcla de primers nucleótidos, 5 &#956;L buffer 10X,   2 &#956;L de MgCl2 25 mM, 0,2 &#956;L de enzima Hot Start   Taq ADN polimerasa 5 &#956;L (Qiagen), 5 &#956;L de ADN y   agua grado molecular hasta completar un volumen   final de 50 &#956;L. Los tubos de PCR se colocaron en   el termociclador (Applied Biosystems 9700) y se   siguió el protocolo de amplificación: primera etapa,   un ciclo de 15 min de desnaturalización a 95 °C, diez   ciclos de desnaturalización a 95 °C durante 30 s y   elongación a 58 °C durante 120 s. Segunda etapa:   veinte ciclos de desnaturalización a 95 °C por 25 s,   hibridación a 53 °C por 40 s y elongación a 70 °C   por 40 s; finalmente, se realizó una extensión a 70 °C   por 8 min. Cuando se procesó muestras de esputo se   incrementó el número de ciclos de la segunda etapa   a treinta ciclos. En cada corrida de PCR se consideró   una muestra blanco (agua estéril) y una muestra   control (<i>M. tuberculosis</i> H37Rv: cepa pansensible a   drogas antituberculosas). El proceso de hibridación   se realizó en un equipo semiautomatizado GTBlot   48 (Hain Lifesciences, Nehren, Alemania) donde se   corrieron simultáneamente hasta 48 muestras. El   programa se inició luego de mezclar previamente   20 &#956;L del producto de amplificación más 20 &#956;L de   solución desnaturalizante en una bandeja (tray) de 48   posiciones y dejando incubar a temperatura ambiente   por 5 min, automáticamente el equipo añade 1 mL   de buffer de hibridación (HYB) precalentado en   cada posición de muestra, se colocaron las tiras de   nitrocelulosa y se incubó a 45 °C por 30 min. Luego,   el equipo aspiró el exceso de HYB y añadió 1 mL de   solución astringente (STR) a cada posición, se incubó   las tiras a 45 °C por 15 min seguido de un lavado con   1 mL de solución de aclarado (RIN). Posteriormente,   el equipo añade el conjugado de streptavidinafosfatasa   alcalina diluido 1/100 y se incuba las tiras   a temperatura ambiente por 30 min. La detección   colorimétrica de los amplicones hibridados o sondas,   ocurre luego de añadir el sustrato diluido y de   incubar las tiras por 8 min. Las tiras fueron secadas   y trasladadas en la bandeja y colocadas al equipo   GenoScan (Hain Lifesciences, Nehren, Alemania)   para su lectura a través del software BLOTRIX (Hain   Lifesciences) que automáticamente lee las bandas   de las tiras y determina si la muestra pertenece al   complejo <i>M. tuberculosis</i>; además, simultáneamente   determina si la muestra es sensible, monorresistente   a una de las drogas o resistente a ambas drogas;   sin embargo, el analista debe validar los resultados   obtenidos por el software.</font></p>      <p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   Para la evaluación estadística del sistema Genotype&#174   MTBDRplus frente al método estándar, se utilizó   el programa EPIDATv3.1; donde se calcularon los   valores estadísticos necesarios para la evaluación del   desempeño del método molecular.</font></p>      <p align="justify"><i><font face="Verdana" size="2">   HALLAZGOS</font></i></p>      <p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   Del análisis de los cultivos por APP, se determinó que 40   (42,1%) cultivos fueron resistentes a INH y 35 (36,8%)   fueron resistentes a RIF encontrándose además 33   (34,7%) cultivos MDR. Del mismo modo, al evaluar los   esputos se encontró que 31 fueron resistentes a INH y   24 resistentes a RIF mientras que 21 fueron MDR.</font></p>      <p align="justify"><a name="tab01"></a></p>      ]]></body>
<body><![CDATA[<p align="center">      <a href="/img/revistas/rpmesp/v29n1/a14tab01a.jpg">  <img src="/img/revistas/rpmesp/v29n1/a14tab01.jpg" border="1"></a></p>      <p align="justify">&nbsp;</p>      <p align="justify"><font face="Verdana" size="2">                                    En el análisis de los cultivos con Genotype&#174MTBDRplus   se encontró que 40 (42,1%) fueron resistentes a INH; 37   (38,9%) a RIF y 34 (35,8%) con patrón de resistencia   a ambas drogas (MDR). Los esputos evaluados por el   método molecular dieron como resultado 33 resistentes   a INH, 23 a RIF y 21 MDR. En la <a href="#tab01">Tabla 1</a> se muestran los   resultados de susceptibilidad a INH y RIF obtenidos con   el kit Genotype&#174MTBDRplus comparado con el método   de APP, tanto para los cultivos como para esputo.</font></p>      <p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   En la <a href="#tab02">Tabla 2</a> se muestra el análisis de la comparación   entre los cultivos y la prueba molecular donde la   sensibilidad y especificidad para RIF fue de 100 y 97,5%   respectivamente, mientras que para INH la sensibilidad   y especificidad fue de 97,5 y 98,18% respectivamente;   para el caso de muestras MDR, la sensibilidad y   especificidad fueron muy similares, 96,97 y 96,77%   respectivamente. Al analizar la prueba molecular frente   a esputo se obtuvieron resultados similares a los cultivos   (<a href="#tab02">Tabla 2</a>).</font></p>      <p align="justify"><a name="tab02"></a></p>      <p align="center">      <a href="/img/revistas/rpmesp/v29n1/a14tab02a.jpg">  <img src="/img/revistas/rpmesp/v29n1/a14tab02.jpg" border="1"></a></p>      <p align="justify">&nbsp;</p>      <p align="justify"><i><font face="Verdana" size="2">   FRECUENCIA DE MUTACIONES DETECTADAS POR   GENOTYPE&#174MTBDRPLUS</font></i></p>      <p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   Las mutaciones más frecuentes en las muestras que   presentaron resistencia se muestran en la <a href="#tab03">Tabla 3</a>.   Con respecto a RIF, las mutaciones y la ausencia de   las bandas WT más frecuentes fueron: rpo&#946; Mut3 con   56,4% (35/62), rpo&#946; Mut1 con 24,2% (15/62), ausencia   de WT 7 con 6,4% (4/62) y ausencia de WT 8 con el 4,8%   (3/62). Del mismo modo, para isoniacida las mutaciones   y ausencia de WT más frecuentes fueron: katG Mut1 con   71,2% (52/73), katG Mut2 con 5,5% (4/73) y inhA Mut1   con 13,7% (10/73). Para esta misma droga se encontró   cuatro muestras con mutación en ambos genes siendo   la combinación katG Mut1 + inhA Mut1 la más frecuente   con un 4,1% (3/73).</font></p>      <p align="justify"><a name="tab03"></a></p>      ]]></body>
<body><![CDATA[<p align="center">      <img src="/img/revistas/rpmesp/v29n1/a14tab03.jpg"></p>      <p align="justify">&nbsp;</p>      <p align="justify"><b><font face="Verdana" size="2">DISCUSIÓN</font></b></p>      <p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   En el presente estudio, la prueba molecular   Genotype&#174MTBDRplus diseñada para la detección de   resistencia a isoniacida y rifampicina, fue comparada   con el método de referencia de proporciones agar en   placa. Se registró una elevada concordancia para cada   una de las drogas así como para la condición MDR,   tanto en cultivos como en muestras de esputo.</font></p>      <p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   Los resultados de sensibilidad y especificidad obtenidos   en este estudio, tanto para RIF, INH y para ambas drogas   simultáneamente (MDR,) fueron comparables con los   resultados obtenidos por otras investigaciones (5, 9-11)   demostrando su utilidad para la detección rápida de la   resistencia a drogas antituberculosas. Los valores del   índice de Youden demuestran que la prueba molecular   es muy eficiente para detectar la resistencia a las   drogas antituberculosas, sobre todo cuando la muestra   es esputo, siendo sus resultados muy confiables.</font></p>      <p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   La elevada sensibilidad de la prueba molecular para   detectar resistencia a rifampicina puede explicarse   por el hecho de que las principales mutaciones de   resistencia se encuentran en la región core de 81pb   del gen rpo&#946;; en este estudio el 82,2% de todas las   mutaciones encontradas se ubicaron en esa región,   siendo las mutaciones Mut3 y Mut1(S531L y D516V   respectivamente) las más frecuentes; sin embargo,   existe un 14,4% de las muestras cuya resistencia se   debe a la ausencia de las bandas WT (Tabla 4) lo   que indicaría que otras mutaciones están presentes   en estas muestras y que no se encuentran fijadas en   la tira reactiva. Por ejemplo, la banda WT 7 señala   las posiciones de los codones 526 a 529, dentro de   esa región, la sonda de mutación Mut 2A detecta la   mutación en el codón 526 (H526Y, histidina por tirosina)   mientras que la sonda Mut2B detecta el cambio H526D   (histidina por ácido aspártico), la ausencia de WT 7 y   sus correspondientes sondas de mutación indican que   la mutación se dio en posiciones de codones cercanos   a la posición 526, es decir que se puede haber dado en   las posiciones 527, 528 o 529. La variabilidad genética   de las cepas podría ser el responsable de la existencia   de estas mutaciones, por tanto, el secuenciamiento   de ADN de esta región permitiría determinar qué   mutaciones se encuentran presentes en este tipo de   muestras.</font></p>      <p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   Similar resultado se obtuvo al analizar las mutaciones   que otorgan resistencia a isoniacida, donde la resistencia   del 76,7% de las muestras se debe a la mutación en   el gen katG (cambio en el codón S315T, serina por   treonina) donde la mutación katG Mut1 es la más   frecuente, lo que indica, además, que estas muestras   presentan resistencia de alto nivel a la droga. El 13,7%   de las cepas presenta resistencia de bajo nivel, siendo   la mutación inhA Mut1 la más frecuente (15 C&#8594;T). Se   ha observado que la ausencia de bandas WT en ambos   genes así como muestras que presentaron mutaciones   de alto y bajo nivel a la droga simultáneamente son poco   frecuentes en este estudio.</font></p>      <p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   Las mutaciones encontradas en las muestras de esputo   analizadas son las mismas que se encontraron cuando   se evaluaron los cultivos, lo cual confirma que katG   Mut1, inhA Mut1 y rpo&#946; Mut3 son las mutaciones más   prevalentes.</font></p>      <p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   En la actualidad los métodos microbiológicos para   determinar la resistencia a drogas antituberculosas   demandan mucho tiempo. El método de APP demora   30 días a partir del cultivo para la obtención del   resultado, mientras los métodos de BACTEC-460 y   MODS (12,13) demoran entre 8 a 15 días respectivamente,   desde la obtención de la muestra hasta la emisión   de los resultados. Sin embargo, con la aparición de   este método molecular este tiempo se ha acortado   sustancialmente a un máximo de 72 horas. La aparición   de otros métodos como el INNO-LiPA Rif.TB (14) y más   recientemente el método de GeneXpert (15,16) han probado   ser metodologías muy sensibles, específicas y rápidas   para la detección de resistencia de <i>M. tuberculosis</i> a   partir de esputo; sin embargo, ambos métodos solo   detectan resistencia a RIF. Adicionalmente, en este   estudio hemos visto que la monorresistencia a INH   (42,1% por APP y genotype) es más prevalente que   la monorresistencia a RIF por lo que los métodos   moleculares mencionados anteriormente no podrían   detectar este tipo de muestras.</font></p>      <p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   Se debe señalar que la prueba Genotype&#174MTBDRplus   requiere que la muestra de esputo sea frotis positivo para   poder utilizarlo (6). Sin embargo, este requisito no sería   problema pues todos los puestos de salud del MINSA   realizan baciloscopías para diagnosticar la enfermedad,   estando en la capacidad de enviar las muestras al   laboratorio donde se realiza el método molecular.</font></p>      ]]></body>
<body><![CDATA[<p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   Como se ha demostrado en este estudio, la prueba   molecular tiene elevada concordancia frente al   método de referencia, además de una gran rapidez   (48 h desde la llegada de la muestra al laboratorio)   detectando la resistencia a INH, RIF y a ambas drogas   simultáneamente (TB-MDR) a partir de una muestra   de esputo baciloscopía positiva. Sin embargo, una   limitación del método molecular es que requiere de   equipamiento y personal entrenado para la ejecución de   la prueba, por lo que este tipo de metodologías deben ser   realizadas en laboratorios con infraestructura adecuada,   equipamiento y personal entrenado. Otra limitación es   que se necesita una inversión alta para establecer la   prueba Genotype&#174MTBDRplus en un laboratorio, pero   el beneficio que se da a la población es valioso, puesto   que la prueba molecular puede determinar la resistencia   del bacilo a las drogas antituberculosas en un máximo   de 72 horas a partir de esputo frotis positivo, y se puede   procesar entre 12 a 48 muestras simultáneamente lo que   constituye una herramienta muy útil en el diagnóstico y   manejo de la tuberculosis.</font></p>      <p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   Por otro lado, se deben realizar otras aproximaciones   como estudios de costo-beneficio que complementen el   desempeño de la prueba demostrada en este trabajo.   Actualmente se está terminando de realizar un estudio   de validación en campo, cuyos resultados serán   publicados próximamente.</font></p>      <p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   Finalmente, se concluye que Genotype&#174MTBDRplus   tiene una alta sensibilidad y especificidad para la   detección de resistencia a INH y RIF simultáneamente   (TB-MDR) en muestras de esputo y cultivo provenientes   de laboratorio y que puede constituirse en una   herramienta alternativa para la detección rápida de la   resistencia de estas drogas antituberculosas.</font></p>      <p align="justify"><b><font face="Verdana" size="2">   AGRADECIMIENTOS</font></b></p>      <p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   Los autores agradecen por la realización de este trabajo de   investigación: A la compañía Alemana Hain Lifescience por   proveernos los insumos necesarios para este estudio. A los   Drs. David Hain, Andreas Hillemann y a la Dra. Antje Beneke   por su dedicación y orientación en la capacitación del personal   en la metodología, al Blgo. Manuel Céspedes, al Dr. Pedro   Valencia y al Dr. César Cabezas, por su apoyo en la realización   del estudio.</font></p>      <p align="justify"><b><i><font face="Verdana" size="2">   Contribuciones de autoría</font></i></b></p>      <p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   LA, AM y OC participaron en la concepción y diseño del   trabajo; NQ y LV en la selección de las muestras y análisis   de la prueba referencial APP; MG en la ejecución y análisis   de la prueba molecular; EL, EV, JR, MA y RS en la ejecución   de la prueba referencial APP; NQ, LV, LA y OC en la revisión   crítica del manuscrito; OC y LA en la redacción del manuscrito   e interpretación de los datos Todos los autores aprobaron la   versión final del trabajo.</font></p>      <p align="justify"><b><i><font face="Verdana" size="2">   Fuentes de financiamiento</font></i></b></p>      <p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   Este trabajo fue financiado por el programa de investigaciones   del Instituto Nacional de Salud.</font></p>      <p align="justify"><b><i><font face="Verdana" size="2">   Conflictos de interés</font></i></b></p>      ]]></body>
<body><![CDATA[<p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   Los autores declaran no tener conflictos de interés.</font></p>      <p align="justify">&nbsp;</p>      <p align="justify"><b><font face="Verdana" size="2">   REFERENCIAS BIBLIOGRÁFICAS</font></b></p>      <p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   1. World Health Organization. Global Tuberculosis Control   2010: Annex 2 &#91Internet&#93;. Ginebra: WHO; 2010 &#91citado el 11   de noviembre de 2011&#93;. Disponible en:  <a href="http://www.who.int/tb/publications/global_report/2010/gtbr10_a2.pdf">  http://www.who.int/tb/publications/global_report/2010/gtbr10_a2.pdf</a></font></p>      <!-- ref --><p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   2. Comité de Tuberculosis Extremadamente Resistente.   Análisis de la situación actual y propuesta de lineamientos   técnicos para el control y prevención de la tuberculosis   resistente en el Perú, 2008. Lima: TB XDR; 2008.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2628863&pid=S1726-4634201200010001400002&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>      <!-- ref --><p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   3. Telenti A, Honoré N, Bernasconi C, March J, Ortega A, Heym   B, Takiff HE, Cole ST. Genotyping assessment of isoniazid   and rifampin resistance in <i>Mycobacterium tuberculosis</i>: a   blind study at reference laboratory level. J Clin Microbiol.   1997;35(3):719-23.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2628865&pid=S1726-4634201200010001400003&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>      <!-- ref --><p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   4. Agapito J, Neyra V, Castro J, Accinelli R, Rodríguez I,   Espinoza JR. Caracterización de las mutaciones en el gen   rpo&#946; Asociadas a la resistencia a rifampicina en pacientes   con tuberculosis pulmonar. Rev Peru Med. Exp Salud   Publica. 2002;19(3):117-23.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2628867&pid=S1726-4634201200010001400004&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>      ]]></body>
<body><![CDATA[<!-- ref --><p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   5. Hillemann D, Rusch-Gerdes S, Richter E. Evaluation of the   GenoType MTBDRplus assay for rifampin and isoniazid   susceptibility testing of <i>Mycobacterium tuberculosis</i> strains   and clinical specimens. J Clin Microbiol. 2007;45(8):2635-   40.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2628869&pid=S1726-4634201200010001400005&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>      <p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   6. Hain Lifescience &#91Internet&#93;. Nehren, Germany: Hain   Lifescience GmbH; 2010 &#91actualizada el 22 de agosto del   2009; citada el 12 julio del 2010&#93;. GenoType&#174 MTBDRplus;   &#91aprox. 2 pantallas&#93;. Disponible en:  <a href="http://www.hainlifescience.de/en/products/microbiology/mycobacteria/genotype-mtbdrplus.html">  http://www.hainlifescience.de/en/products/microbiology/mycobacteria/genotype-mtbdrplus.html</a></font></p>      <!-- ref --><p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   7. Kent PT, Kubica GP (ed). Public health mycobacteriology.   A guide for the level III laboratory. Atlanta, GA: U.S.   Department of Health, Education, and Welfare, Centers for   Disease Control and Prevention; 1995.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2628872&pid=S1726-4634201200010001400007&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>      <p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   8. World Health Organization &#91Internet&#93;. Geneva: WHO; c2012   &#91citada el 25 abril del 2011&#93;. Laboratory services in TB   control (Publication no. WHO/tb/98.258.). Disponible en:   <a href="http://www.who.int/tb/publications/who_tb_98_258/en/">  http://www.who.int/tb/publications/who_tb_98_258/en/</a></font></p>      <!-- ref --><p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   9. Lacoma A, Garcia-Sierra N, Prat C, Ruiz-Manzano J,   Haba L, Rosés S, et al. GenoType MTBDRplus assay for   molecular detection of rifampin and isoniazid resistance in   <i>Mycobacterium tuberculosis</i> strains and clinical samples. J   Clin Microbiol. 2008;46(11):3660-7.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2628875&pid=S1726-4634201200010001400009&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>      <!-- ref --><p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   10. Barnard M, Albert H, Coetzee G, O’Brien R, Bosman   ME. Rapid molecular screening for multidrug-resistant   tuberculosis in a high-volume public health laboratory   in South Africa. Am J Respir Crit Care Med. 2008 Apr   1;177(7):787-92.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2628877&pid=S1726-4634201200010001400010&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>      ]]></body>
<body><![CDATA[<!-- ref --><p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   11. Huang WL, Chi TL, Wu MH, Jou R. Performance   assessment of the GenoType MTBDRsl test and DNA   sequencing for detection of second-line and ethambutol   drug resistance among patients infected with multidrugresistant   <i>Mycobacterium tuberculosis</i>. J Clin Microbiol.   2011;49(7):2502-8.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2628879&pid=S1726-4634201200010001400011&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>      <!-- ref --><p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   12. Caviedes L, Lee TS, Gilman RH, Sheen P, Spellman   E, Lee EH, et al. Rapid, efficient detection and drug   susceptibility testing of <i>Mycobacterium tuberculosis</i> in   sputum by microscopic observation of broth cultures. The   Tuberculosis Working Group in Peru. J Clin Microbiol.   2000;38(3):1203-8.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2628881&pid=S1726-4634201200010001400012&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>      <!-- ref --><p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   13. Moore DA, Evans CA, Gilman RH, Caviedes L,   Coronel J, Vivar A, et al. Microscopic-observation drugsusceptibility   assay for the diagnosis of TB. N Engl J Med.   2006;355(15):1539-50.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2628883&pid=S1726-4634201200010001400013&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>      <!-- ref --><p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   14. Rossau R, Traore H, De Beenhouwer H, Mijs W, Jannes   G, De Rijk P, et al. Evaluation of the INNO-LiPA Rif. TB   assay, a reverse hybridization assay for the simultaneous   detection of <i>Mycobacterium tuberculosis</i> complex and   its resistance to rifampin. Antimicrob Agents Chemother.   1997;41(10):2093-8.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2628885&pid=S1726-4634201200010001400014&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>      <!-- ref --><p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   15. Boehme CC, Nabeta P, Hillemann D, Nicol MP, Shenai S,   Krapp F, et. al. Rapid molecular detection of tuberculosis   and rifampin resistance. N Engl J Med. 2010;363(11):1005-   15.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2628887&pid=S1726-4634201200010001400015&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>      ]]></body>
<body><![CDATA[<!-- ref --><p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   16. Helb D, Jones M, Story E, Boehme C, Wallace E, Ho K,   et. al. Rapid detection of <i>Mycobacterium tuberculosis</i> and   rifampin resistance by use of on-demand, near-patient   technology. J Clin Microbiol. 2010;48(1):229-37.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2628889&pid=S1726-4634201200010001400016&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>      <p align="justify">&nbsp;</p>      <p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   <b>Correspondencia: </b>Omar Cáceres Rey</font></p>      <p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   <b>Dirección:</b> Av. Defensores del Morro N.º 2268, Lima 9, Perú.</font></p>      <p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   <b>Teléfono:</b> (511) 6176200 ext. 1424</font></p>      <p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   <b>Correo electrónico:</b> <a href="mailto:ocaceres&#64ins.gob.pe">ocaceres&#64ins.gob.pe</a>, <a href="mailto:ocrey2002&#64yahoo.com">  ocrey2002&#64yahoo.com</a></font></p>      <p align="justify">&nbsp;</p>      <p align="justify"><font face="Verdana" size="2">   <b>Recibido:</b> 12-09-11 </font></p>      <p align="justify"><font face="Verdana" size="2"><b>Aprobado: </b>25-01-12</font></p>      ]]></body>
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